Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MixPad ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MixPad ondersteunt zijn .MPDP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MixPad op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MixPad.
MixPad kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MixPad en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MixPad.