Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Minimal Board Editor ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Minimal Board Editor ondersteunt zijn .MB3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Minimal Board Editor op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Minimal Board Editor.
Minimal Board Editor kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Minimal Board Editor en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Minimal Board Editor.