Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Microsoft Windows Millennium Edition ondersteunt minimaal 6 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Microsoft Windows Millennium Edition ondersteunt zijn .DLL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Microsoft Windows Millennium Edition op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Microsoft Windows Millennium Edition.
Microsoft Windows Millennium Edition kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Microsoft Windows Millennium Edition en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Microsoft Windows Millennium Edition.