Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Microsoft Organization Chart ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Microsoft Organization Chart ondersteunt zijn .MSO. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Microsoft Organization Chart op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Microsoft Organization Chart.
Microsoft Organization Chart kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Microsoft Organization Chart en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Microsoft Organization Chart.