Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MicroPAVER ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MicroPAVER ondersteunt zijn .E50. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MicroPAVER op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MicroPAVER.
MicroPAVER kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MicroPAVER en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MicroPAVER.