Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. McAfee VirusScan Enterprise ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die McAfee VirusScan Enterprise ondersteunt zijn .UPD. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in McAfee VirusScan Enterprise op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door McAfee VirusScan Enterprise.
McAfee VirusScan Enterprise kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via McAfee VirusScan Enterprise en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door McAfee VirusScan Enterprise.