Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MBS2MBX ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MBS2MBX ondersteunt zijn .MBS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MBS2MBX op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MBS2MBX.
MBS2MBX kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MBS2MBX en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MBS2MBX.