Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MATLAB ondersteunt minimaal 24 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MATLAB ondersteunt zijn .NC. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MATLAB op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MATLAB.
MATLAB kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MATLAB en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MATLAB.