Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MapGuide Viewer ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MapGuide Viewer ondersteunt zijn .MWF. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MapGuide Viewer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MapGuide Viewer.
MapGuide Viewer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MapGuide Viewer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MapGuide Viewer.