Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MainLog ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MainLog ondersteunt zijn .MLW. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MainLog op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MainLog.
MainLog kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MainLog en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MainLog.