Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Magix Photo Manager ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Magix Photo Manager ondersteunt zijn .MXC3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Magix Photo Manager op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Magix Photo Manager.
Magix Photo Manager kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Magix Photo Manager en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Magix Photo Manager.