Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Magix Music Studio ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Magix Music Studio ondersteunt zijn .RAP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Magix Music Studio op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Magix Music Studio.
Magix Music Studio kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Magix Music Studio en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Magix Music Studio.