Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Lost Marble Moho ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Lost Marble Moho ondersteunt zijn .MOHO. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Lost Marble Moho op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Lost Marble Moho.
Lost Marble Moho kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Lost Marble Moho en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Lost Marble Moho.