Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Lexar Secure II ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Lexar Secure II ondersteunt zijn .LXV. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Lexar Secure II op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Lexar Secure II.
Lexar Secure II kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Lexar Secure II en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Lexar Secure II.