Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. LEGO Digital Designer ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die LEGO Digital Designer ondersteunt zijn .LXF. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in LEGO Digital Designer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door LEGO Digital Designer.
LEGO Digital Designer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via LEGO Digital Designer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door LEGO Digital Designer.