Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. LabScribe 2 ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die LabScribe 2 ondersteunt zijn .IWXDATA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in LabScribe 2 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door LabScribe 2.
LabScribe 2 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via LabScribe 2 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door LabScribe 2.