Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Jot+ Notes ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Jot+ Notes ondersteunt zijn .JOT. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Jot+ Notes op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Jot+ Notes.
Jot+ Notes kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Jot+ Notes en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Jot+ Notes.