Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. JBoss Application Server ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die JBoss Application Server ondersteunt zijn .XDOCLET. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in JBoss Application Server op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door JBoss Application Server.
JBoss Application Server kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via JBoss Application Server en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door JBoss Application Server.