Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Jazz Jackrabbit 2 ondersteunt minimaal 6 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Jazz Jackrabbit 2 ondersteunt zijn .J2I. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Jazz Jackrabbit 2 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Jazz Jackrabbit 2.
Jazz Jackrabbit 2 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Jazz Jackrabbit 2 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Jazz Jackrabbit 2.