Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Javelin PDF Reader ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Javelin PDF Reader ondersteunt zijn .DRMZ. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Javelin PDF Reader op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Javelin PDF Reader.
Javelin PDF Reader kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Javelin PDF Reader en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Javelin PDF Reader.