Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Indigo Renderer ondersteunt minimaal 4 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Indigo Renderer ondersteunt zijn .IGM. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Indigo Renderer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Indigo Renderer.
Indigo Renderer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Indigo Renderer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Indigo Renderer.