Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. IBM LinkWay ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die IBM LinkWay ondersteunt zijn .PCJ. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in IBM LinkWay op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door IBM LinkWay.
IBM LinkWay kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via IBM LinkWay en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door IBM LinkWay.