Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Heroes 3 Map Editor ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Heroes 3 Map Editor ondersteunt zijn .H3M. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Heroes 3 Map Editor op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Heroes 3 Map Editor.
Heroes 3 Map Editor kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Heroes 3 Map Editor en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Heroes 3 Map Editor.