Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Help & Manual ondersteunt minimaal 7 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Help & Manual ondersteunt zijn .HMX. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Help & Manual op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Help & Manual.
Help & Manual kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Help & Manual en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Help & Manual.