Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Headshape Modding 3D Tool ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Headshape Modding 3D Tool ondersteunt zijn .N2KM. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Headshape Modding 3D Tool op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Headshape Modding 3D Tool.
Headshape Modding 3D Tool kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Headshape Modding 3D Tool en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Headshape Modding 3D Tool.