Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. gxine ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die gxine ondersteunt zijn .MOD. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in gxine op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door gxine.
gxine kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via gxine en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door gxine.