Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Graphical Analysis ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Graphical Analysis ondersteunt zijn .GA3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Graphical Analysis op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Graphical Analysis.
Graphical Analysis kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Graphical Analysis en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Graphical Analysis.