Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. GNU Libtool ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die GNU Libtool ondersteunt zijn .LAI. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in GNU Libtool op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door GNU Libtool.
GNU Libtool kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via GNU Libtool en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door GNU Libtool.