Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. GNU Compiler Collection ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die GNU Compiler Collection ondersteunt zijn .GCDA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in GNU Compiler Collection op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door GNU Compiler Collection.
GNU Compiler Collection kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via GNU Compiler Collection en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door GNU Compiler Collection.