Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. GIMP ondersteunt minimaal 47 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die GIMP ondersteunt zijn .AI. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in GIMP op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door GIMP.
GIMP kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via GIMP en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door GIMP.