Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Geospiza FinchTV ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Geospiza FinchTV ondersteunt zijn .FASTA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Geospiza FinchTV op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Geospiza FinchTV.
Geospiza FinchTV kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Geospiza FinchTV en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Geospiza FinchTV.