Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Generic Modeling Environment ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Generic Modeling Environment ondersteunt zijn .XME. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Generic Modeling Environment op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Generic Modeling Environment.
Generic Modeling Environment kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Generic Modeling Environment en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Generic Modeling Environment.