Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. GC-PowerStation ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die GC-PowerStation ondersteunt zijn .GWK. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in GC-PowerStation op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door GC-PowerStation.
GC-PowerStation kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via GC-PowerStation en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door GC-PowerStation.