Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Fugawi Global Navigator ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Fugawi Global Navigator ondersteunt zijn .RTE. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Fugawi Global Navigator op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Fugawi Global Navigator.
Fugawi Global Navigator kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Fugawi Global Navigator en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Fugawi Global Navigator.