Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Fresh Download ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Fresh Download ondersteunt zijn .FDPART. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Fresh Download op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Fresh Download.
Fresh Download kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Fresh Download en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Fresh Download.