Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FreeWRL ondersteunt minimaal 4 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FreeWRL ondersteunt zijn .WRL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FreeWRL op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FreeWRL.
FreeWRL kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FreeWRL en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FreeWRL.