Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Free Hide Folder ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Free Hide Folder ondersteunt zijn .FHF. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Free Hide Folder op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Free Hide Folder.
Free Hide Folder kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Free Hide Folder en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Free Hide Folder.