Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Free Download Manager ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Free Download Manager ondersteunt zijn .PART. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Free Download Manager op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Free Download Manager.
Free Download Manager kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Free Download Manager en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Free Download Manager.