Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Fortran Compiler ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Fortran Compiler ondersteunt zijn .F90. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Fortran Compiler op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Fortran Compiler.
Fortran Compiler kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Fortran Compiler en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Fortran Compiler.