Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FMS32 ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FMS32 ondersteunt zijn .TON. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FMS32 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FMS32.
FMS32 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FMS32 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FMS32.