Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FindinSite-JS ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FindinSite-JS ondersteunt zijn .HIS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FindinSite-JS op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FindinSite-JS.
FindinSite-JS kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FindinSite-JS en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FindinSite-JS.