Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FinalBuilder ondersteunt minimaal 5 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FinalBuilder ondersteunt zijn .SLN. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FinalBuilder op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FinalBuilder.
FinalBuilder kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FinalBuilder en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FinalBuilder.