Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Final Fantasy XI ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Final Fantasy XI ondersteunt zijn .IBF. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Final Fantasy XI op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Final Fantasy XI.
Final Fantasy XI kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Final Fantasy XI en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Final Fantasy XI.