Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FileMaker Go ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FileMaker Go ondersteunt zijn .FMP12. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FileMaker Go op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FileMaker Go.
FileMaker Go kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FileMaker Go en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FileMaker Go.