Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FidoCAD ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FidoCAD ondersteunt zijn .FCL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FidoCAD op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FidoCAD.
FidoCAD kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FidoCAD en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FidoCAD.