Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. FDRTools Basic ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die FDRTools Basic ondersteunt zijn .FDRTEMPLATES. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in FDRTools Basic op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door FDRTools Basic.
FDRTools Basic kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via FDRTools Basic en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door FDRTools Basic.