Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. fda2aifc ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die fda2aifc ondersteunt zijn .FDA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in fda2aifc op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door fda2aifc.
fda2aifc kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via fda2aifc en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door fda2aifc.