Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Fade In ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Fade In ondersteunt zijn .FADEIN. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Fade In op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Fade In.
Fade In kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Fade In en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Fade In.