Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. eSite Builder ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die eSite Builder ondersteunt zijn .NXG. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in eSite Builder op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door eSite Builder.
eSite Builder kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via eSite Builder en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door eSite Builder.