Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. ESET Smart Security ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die ESET Smart Security ondersteunt zijn .NUP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in ESET Smart Security op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door ESET Smart Security.
ESET Smart Security kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via ESET Smart Security en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door ESET Smart Security.